Công ty TNHH Dược phẩm Hoa Sen được thành lập tháng 11 năm 2002, với nghành nghề kinh doanh chính ban đầu là phân phối Dược phẩm. Từ tháng 6 năm 2003, Công ty lập dự án “XÂY DỰNG NHÀ MÁY SẢN XUẤT THUỐC TỪ DƯỢC LIỆU”, có công suất thiết kế 250 tấn dược liệu/năm với tổng vốn đầu tư ban đầu là 9 tỷ đồng. Dự án được triển khai thực hiện trên diện tích 7000 m2 tại KCN Mỹ Xá – TP.Nam Định, Tỉnh Nam Định. Sau hơn hai năm tiến hành thực hiện dự án, Công ty đã hoàn thành việc xây dựng nhà xưởng , lắp đặt máy móc thiết bị, bao gồm các dây chuyền sản xuất đi từ công đoạn đầu tiên là chiết xuất dược liệu đến công đoạn bào chế sản phẩm và công đoạn đóng gói hoàn thiện sản phẩm. Cuối năm 2006, Công ty được Bộ Y tế thẩm định cơ sở vật chất kỹ thuật và cấp giấy chứng nhận “ĐỦ ĐIỀU KIỆN SẢN XUẤT THUỐC TỪ DƯỢC LIỆU“, với các dạng bào chế gồm: Viên nén, viên bao đường, viên bao film, viên nang cứng, viên hoàn cứng, thuốc cốm và thuốc nước. Đến nay Công ty đã được Bộ Y tế cấp giấy phép sản xuất và lưu hành trên toàn quốc cho 15 sản phẩm thuốc Đông dược và trên 20 sản phẩm Thực phẩm chức năng.